<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<feed xmlns="http://www.w3.org/2005/Atom" xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/">
<title>Medical Laboratory</title>
<link href="http://dspace.mahdi.edu.sd:8080/xmlui//xmlui/handle/123456789/625" rel="alternate"/>
<subtitle/>
<id>http://dspace.mahdi.edu.sd:8080/xmlui//xmlui/handle/123456789/625</id>
<updated>2026-05-22T19:36:17Z</updated>
<dc:date>2026-05-22T19:36:17Z</dc:date>
<entry>
<title>Evaluation Histochemical of Mucins in Female Breast Tumors by Alcian blue and PAS in Kosti Oncology</title>
<link href="http://dspace.mahdi.edu.sd:8080/xmlui//xmlui/handle/123456789/1303" rel="alternate"/>
<author>
<name>Salih Salih  Shawkat, Marwa</name>
</author>
<id>http://dspace.mahdi.edu.sd:8080/xmlui//xmlui/handle/123456789/1303</id>
<updated>2026-05-10T09:58:58Z</updated>
<published>2024-01-01T00:00:00Z</published>
<summary type="text">Evaluation Histochemical of Mucins in Female Breast Tumors by Alcian blue and PAS in Kosti Oncology
Salih Salih  Shawkat, Marwa
اورام الثدي هي نمو غير طبيعي في انسجة الثدي , ويمكن ان تكون حميدة او خبيثة . يعد سرطان الثدي ثاني نوع من السرطانات التي تؤدي الي الوفاة عالميا, وهو النوع الأكثر انتشارا بين النساء في السودان . تهدف الدراسة الي تقييم التعبير الهيستوكيميائي عن الميوسين في اورام الاناث باستخدام صبغة الالشين الأزرق وحمض البريودك مع محلول الشيفز. أجريت دراسة مقطعية  وصفية علي 60 عينة تتراوح أعمارهم بين (13-95) في معمل الأنسجة المريضة  الخاص بالصندوق القومي للتامين الصحي في مدينة كوستي ولاية النيل الأبيض .تم تضمين العينات وتقسيمها وصبغها وفحصها تحت المجهر وتم تحليل النتائج التي تم الحصول عليها احصائيا باستخدام برنامج الحزمة الإحصائية للعلوم الاجتماعية. أظهرت الدراسة ان النوع الأكثر شيوعا في الأورام كان الورم الليفي (38.3%) , جميعها أظهرت  ميوسين حمضي ومتعادل , ثم التغيرات الليفية الكيسية  (28.3%) ,وجميعها أظهرت ميوسين حمضي ومتعادل . بينما  كانت الأورام الأخرى مثل الورم الورقي والتهاب الثدي المزمن وتمدد القنوات والورم الحليمي داخل القنوات وفرط التنسج  القنوي  تمثل كل منها (1.7%) وأظهرت جميها ميوسين حمضي ومتعادل ,عدا فرط التنسج غير الطبيعي (1.7%) أظهرت ميوسين متعادل فقط. فيما يتعلق بالأورام الخبيثة , كانت نسبة سرطان القنوات العدائية من الدرجة الثالثة (11.7%),حيث أظهرت (10%) منها ميوسين متعادل فقط, بينما  أظهرت  (1.7%)  منها ميوسين حمضي ومتعادل. وبلغت نسبة سرطان القنوات العدائية من الدرجة الثانية (10%), وجميعها أظهرت ميوسين متعادل فقط, بينما كان سرطان الفصيصات (1.7%) واظهر ميوسين حمضي ومتعادل. تشير هذه الدراسة الي ان التعبيير عن الميوسين يمكن ان يكون له دور في تمييز الأورام الحميدة عن الأورام الخبيثة في الثدي .&#13;
&#13;
&#13;
&#13;
  List of contents
Breast tumors are abnormal growth in breast tissue it can be benign or malignant. Breast cancer is second type of cancers that leading death globally. In Sudan is the most common type in women. This study aim to evaluate the histochemical expression of mucin in female breast tumors using Alcian blue and PAS staining method. A descriptive cross sectional study was conducted on 60 samples there ages between (13-95) at Histopathology lab  of National Health Insurance Fund  in Kosti City White Nile State. The samples was embedding ,sectioning, staining, microscopically examined and the results obtained  were statistically analyzed using  SSPS.  The  study showed that  common type of tumors was fibroadenoma (38.3%)  all expressed acid and neutral mucins , then fibrocystic change  (28.3%) also all expressed acid and neutral mucins, while phylloide tumor, chronic mastitis ,ductectasia , intraductal papilloma and  ductal hyperplasia all was represented  (1.7%) for each type  and all expressed acid and neutral mucins, while atypical hyperplasia  (1.7%)  expressed neutral mucin only. Invasive ductal carcinoma grad III (11.7 %), (10%)  of them expressed neutral mucin only except (1.7%) expressed acid and neutral mucins, invasive ductal carcinoma grad II (10%) all expressed neutral mucin only ,while  lobular carcinoma was (1.7%) expressed acid and neutral mucins . The study indicates that  mucin expression may serve as a useful marker in differentiating  benign from  malignant breast tumors .
</summary>
<dc:date>2024-01-01T00:00:00Z</dc:date>
</entry>
<entry>
<title>A dissertation Submitted as a Partial Fulfillment for the Requirements for the Degree of Master in Medical Biochemistry</title>
<link href="http://dspace.mahdi.edu.sd:8080/xmlui//xmlui/handle/123456789/1300" rel="alternate"/>
<author>
<name>Elsadig Abdalla Makeen, Elfatih</name>
</author>
<id>http://dspace.mahdi.edu.sd:8080/xmlui//xmlui/handle/123456789/1300</id>
<updated>2026-04-21T10:41:46Z</updated>
<published>2021-01-01T00:00:00Z</published>
<summary type="text">A dissertation Submitted as a Partial Fulfillment for the Requirements for the Degree of Master in Medical Biochemistry
Elsadig Abdalla Makeen, Elfatih
Background: Polycystic ovary syndrome is a condition associated with chronic anovulation, insulin resistance and androgen excess. Dyslipidemia is the most common metabolic abnormality in PCOS, although the type and extent of findings have not been defined. Women with PCOS are at an increased risk for cardiovascular diseases.  They share many features regarding the metabolic syndrome associated with polycystic ovaries. The study aimed to estimate lipid parameters among ladies with polycystic ovaries syndrome attending teaching hospital of Kosti. Blood samples were collected after obtaining verbal consent from cases and controls. Serum lipids were estimated by enzymatic.&#13;
Result: Serum TC, TG, LDL, VLDL, TC/HDL, LDL/HDL values were elevated were significantly higher in cases than in controls.&#13;
Conclusion: Dyslipidemia seemed to be one of the main factors contributing to an increased risk of coronary artery disease in patients with PCOS.&#13;
Recommendation: Further studies are however required with higher number of cases to confirm the contribution of polycystic ovarian syndrome.&#13;
Key Words: Polycystic ovary syndrome, lipid profile
Background: Polycystic ovary syndrome is a condition associated with chronic anovulation, insulin resistance and androgen excess. Dyslipidemia is the most common metabolic abnormality in PCOS, although the type and extent of findings have not been defined. Women with PCOS are at an increased risk for cardiovascular diseases.  They share many features regarding the metabolic syndrome associated with polycystic ovaries. The study aimed to estimate lipid parameters among ladies with polycystic ovaries syndrome attending teaching hospital of Kosti. Blood samples were collected after obtaining verbal consent from cases and controls. Serum lipids were estimated by enzymatic.&#13;
Result: Serum TC, TG, LDL, VLDL, TC/HDL, LDL/HDL values were elevated were significantly higher in cases than in controls.&#13;
Conclusion: Dyslipidemia seemed to be one of the main factors contributing to an increased risk of coronary artery disease in patients with PCOS.&#13;
Recommendation: Further studies are however required with higher number of cases to confirm the contribution of polycystic ovarian syndrome.&#13;
Key Words: Polycystic ovary syndrome, lipid profile
</summary>
<dc:date>2021-01-01T00:00:00Z</dc:date>
</entry>
<entry>
<title>Association of Insertion/Deletion Gene Polymorphisms of Angiotensin 1 Converting Enzyme and Serum Cystatin C with the Development of Diabetic Kidney Disease among Sudanese Type2 Diabetes Mellitus, White Nile State, 2019.</title>
<link href="http://dspace.mahdi.edu.sd:8080/xmlui//xmlui/handle/123456789/1261" rel="alternate"/>
<author>
<name>Yousif Younis Dyab, : Osman</name>
</author>
<id>http://dspace.mahdi.edu.sd:8080/xmlui//xmlui/handle/123456789/1261</id>
<updated>2025-02-02T10:01:41Z</updated>
<published>2024-01-01T00:00:00Z</published>
<summary type="text">Association of Insertion/Deletion Gene Polymorphisms of Angiotensin 1 Converting Enzyme and Serum Cystatin C with the Development of Diabetic Kidney Disease among Sudanese Type2 Diabetes Mellitus, White Nile State, 2019.
Yousif Younis Dyab, : Osman
يتميز مرض الكلى الناتج عن السكري (DKD) بارتفاع إفراز الألبومين (الزلال) في البول أو انخفاض معدل الترشيح الكبيبي للكلى أو كليهما. ويعتمد التشخيص السريري لمرض الكلى الناتج عن السكري ال (DKD) لدى الأشخاص المصابين بداء السكري من النوع الثاني على استخدام اختبارات الزلالي في البول والكرياتينين في الدم. ولاستكمال التقييم السريري ل(DKD) ضرورة أستخدام مؤشرات حيوية جديدة تساعد على تحسين تشخيص المرض ومراقبته.&#13;
 كان الهدف من هذه الدراسة هو قياس ارتباط مستويات مادتي الكرياتينين والسيساتين سي وتعدد أشكال الجينات (ACE1 (I/D) مع تطور مرض الكلى السكري بين المرضى السودانيين المصابين بداء السكري من النوع الثاني ومقارنة معدل الترشيح الكبيبي (eGFR) لمرضى السكري المقدر باستخدام معادلات GFR المختلفة.&#13;
 أجريت هذه الدراسة في مركز مرضى السكري بمستشفى كوستي التعليمي بولاية النيل الأبيض. شملت الدراسة 250 حالة مصابة بالسكري و150 حالة صحية. تم جمع عينات الدم بعد موافقة مستنيرة.  تم إجراء قياسات نسبة الجلوكوز في الدم أثناء الصيام ومستوى الكرياتينين في الدم والسيساتاتينC باستخدام محلل كيميائي شبه آلي Mindray BA-88A وProtein Analyzer-PA50-Genrui. تم إجراء معدل الترشيح الكبيبي المقدر (eGFR) ومراحل DKD استنادًا إلى أربع معادلات مختلفة وهي eGFR: MDRD وCKD-EPI Creatinine وCKD-EPI Cystatin C وCKD-EPI Creatinine/Cystatin.&#13;
 تم إجراء عزل الحمض النووي باستخدام طريقة التمليح لكل عينة. تم تقييم تعدد الأشكال ACE1 (I/D) للجينات باستخدام PCR. تم جمع عينات البول من المرضى واختبارها للكشف عن الالبيومين . وتم تحليل البيانات باستخدام برنامج SPSS (الإصدار 20؛ SPSS Inc.، Chicago، IL) وتحليل الانحدار الخطي.&#13;
 اعتمادا على ألبومين البول الإيجابي كعلامة تشخيصية لـ DKD، أظهرت دراستنا معدل حدوث ال DKDبنسبة (38٪) بين مرض السكري من النوع الثاني. وكان هناك فرق ذو دلالة إحصائية في العمرp.value= 0.02))، وجلوكوز الدم الصائم ومدة مرض السكري(p.value= 0.001) بين المجموعتين الإيجابية والسلبية لـ DKD. أيضا هناك فروق ذات دلالة إحصائية في مستويات الكرياتينين وسيستاتينسي p.value= 0.001)) بين المجموعتين. وكشف التنميط الجيني (I/D) ACE1 عن توزيع أعلى بكثير لـ DD متماثل الزيجوت (52.7%) في حالات T2DM مقارنة بالحالات الصحية(الضوابط) (32%) (P.value=0.041) وتم العثور على تردد أعلى ل (D allele) (69%) في حالات  T2DM من حالات الضوابط (56%) (P.value 0.051).&#13;
السيستاتينC هو العلامة الحيوية المتفوقة للكشف المبكر عند مرض الكلى الناتج عن السكري ل(DKD) لدى مرضى السكري من النوع الثاني، كما تعد معادلة CKD-EPI Cystatin C الأداة الأكثر دقة لفحص وتحديد مراحل ال(DKD) ، ويعد تعدد أشكال الجينات (I/D) لـ ACE1 عامل خطر لحدوث الDKD الناتج عن داء السكري من النوع الثاني.
Diabetic kidney disease (DKD) is characterized by elevated urine albumin excretion or reduced glomerular filtration rate or both. The clinical diagnosis of DKD in people with Type 2 diabetes depends on the use of albuminuria and serum creatinine tests. Supplementing clinical assessment of DKD with newer biomarker has the potential to improve disease diagnosis and monitoring.&#13;
The aim of this study was to assess the association of serum levels of creatinine, cystatin C and ACE1 (I/D) gene polymorphism with the development of Diabetic Kidney Disease among Sudanese patients with Type 2 diabetes mellitus and to compare the estimated GFR (eGFR) of diabetic patients between different GFR equations.&#13;
 The present study was carried out at the Diabetic Center in Kosti Teaching Hospital, White Nile State, Sudan. The study total 250 diabetic cases and 150 healthy controls. Blood samples were collected after informed consent. Measurements of blood glucose, serum creatinine and cystatin C level were measured using Mindray BA-88A and Protein Analyzer-PA50-Genrui semi-automated chemical analyzer. The estimated glomerular filtration rate (eGFR) and staging of DKD was done based on four different eGFR equations: MDRD, CKD-EPI Creatinine, CKD-EPI Cystatin C, and CKD-EPI Creatinine/Cystatin. The DNA isolation was performed using salting-out method for each sample. ACE1 gene insertion/deletion (I/D) polymorphism was assessed using PCR. Urine specimens were collected from patients and tested for microalbuminuria.The data were analyzed using SPSS (version 20; SPSS Inc., Chicago, IL) software and linear regression analysis.&#13;
Depending on positive urine albumin as the diagnostic marker for DKD, our study demonstrated prevalence of (38%) DKD among Type 2 Diabetes. There was statistically significant difference in age (p-value = 0.02), fasting blood glucose  (p-value = 0.001) and the duration of diabetes (p-value = 0.001) between the DKD positive and DKD negative groups. Also statistically significant differences in serum Creatinine (p-value = 0.001) and CystatinC (p-value = 0.001) levels between the two groups. ACE1 insertion/deletion genotyping revealed a significantly higher distribution of the homozygous DD (52.7%) in T2DM cases than in controls (32%) (P-value = 0.041) and the (D allele) frequency was found to be higher in T2DM cases (69%) than the controls (56%) (P-value= 0.051).&#13;
&#13;
Cystatin C is the superior biomarker for early detection of DKD in Type 2 diabetic patients. CKD-EPI Cystatin C equation is the more accurate tool for screening and staging of DKD. ACE1 gene insertion/deletion (I/D) polymorphism is a risk factor for the development of DKD in Type 2 Diabetes Mellitus.
</summary>
<dc:date>2024-01-01T00:00:00Z</dc:date>
</entry>
<entry>
<title>Iron Status Among End Stage Renal Disease  Patients On Regular Hemodialysis At Abass Ibrahim Mohammed Dialysis Unit, Kositi City, White Nile State, Sudan,  Dec 2018</title>
<link href="http://dspace.mahdi.edu.sd:8080/xmlui//xmlui/handle/123456789/1257" rel="alternate"/>
<author>
<name>Mohammed Zain, Mofida</name>
</author>
<id>http://dspace.mahdi.edu.sd:8080/xmlui//xmlui/handle/123456789/1257</id>
<updated>2024-09-26T10:51:51Z</updated>
<published>2019-01-01T00:00:00Z</published>
<summary type="text">Iron Status Among End Stage Renal Disease  Patients On Regular Hemodialysis At Abass Ibrahim Mohammed Dialysis Unit, Kositi City, White Nile State, Sudan,  Dec 2018
Mohammed Zain, Mofida
علي الرغم من الاحتياطات التي تتبع في مراكز الغسيل الكلوي للحد من مضاعفات الغسيل تبفي الانيمياء مشكلة كبري واحد اهم اسباب تدهور صحة هؤلاء المرضي مما يذيد من معدل الوفيات وسطهم ومن المحتمل انها السبب الرئيسي في حدوث فقر الدم النانج من نقص الحديد                  &#13;
الهدف &#13;
 اجريت هذه الدراسة لتقيم مستوي الحديد في الدم بقياس الفرتین  والترانسفيرين والبرتين الكلي المرتبط بالحيد في مصل مرضي الفشل الكلوي في بمركز عباس ابراهيم محمد للغسيل الكلوي الاساليب &#13;
اجريت هذه الدراسة في السودان بولاية النيل الابيض مدينة كوستي علي مرضي الفشل الكلوي بمركز عباس ابراهيم محمد للغسيل الكلوي في الفترة  في يناير 2019  المشاركين في هذه الدراسة مثل الذكور منهم  %76.93  اما الاناث فشكلت 23.07% من العينة المختارة&#13;
النتائج&#13;
 متوسط مستويات الفريتين الترانسفيرين والبروتين الكلي الرتبط بالحديد في المصل اظهرت قيما احتمالي كلها تعادل  ((0.001 ايضا اظهرت الدراسة عدم وجود علاقة بين هذه المستويات والجنس&#13;
الخاتمة&#13;
 معدل الفريتين والبروتين الكلي المرتبط بالحديد والترانسفيرين في تذايد في هؤلاء المرضي وتظهر الذيادة بوضوح مع طول فترة الغسيل
Objectives: the aims  of this study was  to evaluate serum levels of ferritin and transferrin and total  iron binding capacity among end stage renal disease patients.&#13;
Methods: The study is a cross- sectional study conducted Kosti city, White Nile State in Sudan, in January  2019. Cases represented by Fifty two  Diagnosed (ESRD) patients were involved  in this study, 12 were male and 40 were female all of them older than  17 years another closely matched fifty two healthy taken as control.  (Hemoglobin, Total iron binding capacity, Ferritin, Transferrin,) were estimated.&#13;
Result: the results show significant reduction in the level of Ferritin, Transferrin and Total iron binding capacity compared with reference value. There is no correlation between parameters on side , weight, age and sex on other side. &#13;
Conclusion: Total iron binding capacity, Serum ferritin and transferrin hemoglobin were significantly decreased. That means  anemia and iron deficiency are common in patients with end stage renal disease at Abass Ibrahim center for dialysis despite the current therapeutic measures.&#13;
Key word: ESRD, ferritin, transferrin,
</summary>
<dc:date>2019-01-01T00:00:00Z</dc:date>
</entry>
</feed>
